用户提问的核心在于关心在金融非吸收公众存款案件中，员工是否会受到影响，特别是对于那些可能并不清楚公司实际运营情况的普通员工。他们关注的是自己是否需要承担法律责任，以及如何保障自己的合法权益。
作为一名资深的高级律师，我将从五个方面来详细分析这个问题，并提供相关的法律依据：
1. 直接参与与知情程度根据《刑法》第一百七十六条的规定，非法吸收公众存款罪的主体是单位或个人。如果员工明知公司从事非法活动而积极参与，那么可能会被视为共犯，承担刑事责任。但如果员工不知情或者虽有怀疑但未深入探究，一般不会被追究刑事责任。
2. 职务与职责员工的职务和职责也会影响其责任判定。例如，高层管理人员通常对公司的运营状况负有更大的责任，若他们没有尽到审慎义务，可能会被认定为犯罪。而基层员工通常只执行上级指示，如无明显过错，可能只需配合调查。
3. 收益与获利员工因参与非法活动而获得的不当利益也可能影响责任判定。如果员工从中获取了大量不正当收入，可能会被认为是在非法活动中获益，从而加重责任。
4. 退出与举报如果员工在发现公司违法行为后及时退出并积极举报，可以作为减轻或免除刑事责任的情节考虑。这符合我国《刑法》中的“自首”情节。
5. 司法实践与辩护策略具体处理时，法院还会参考司法解释和当地司法实践。辩护律师可以通过证据展示员工的无知、误信、被动参与等事实，以争取较轻的处罚。
总结：金融非吸收公众存款案件中，员工的责任取决于他们的参与程度、知情状态、职务、获利情况以及他们在发现问题后的行动。虽然存在风险，但在大多数情况下，不知情且无明显过错的员工通常不会受到刑事追责。然而，具体情况需由专业律师根据案情进行详细分析。
